Downstream анализ scRNA-seq данных
Преподаватель:
М.С. Арбатский - лаборант-исследователь Института регенеративной медицины, Медицинский научно-образовательный центр МГУ имени М.В. Ломоносова
Место проведения:
Медицинский научно-образовательный центр МГУ имени М.В. Ломоносова
Количество человек в группе: 10 человек
Продолжительность: 1 час вводная лекция и 2 часа практическое занятие
Необходимый уровень подготовки участников: начинающий.
Описание мастер-класса:
Одной из основных задач интерпретации биологических данных, полученных с помощью секвенирования, в частности с помощью scRNA-seq, является типирование клеток. Известно, что типирование клеток крови, а также клеток нервной ткани выполнить проще, чем типирование клеток соединительной ткани. Соединительная ткань характеризуется разнообразным клеточным составом и клетки находятся на разных стадиях развития. Поэтому, ставший классическим, метод типирования по специфическим маркерам в данном случае не пригоден. На лекции Вы узнаете о новых методах обработки scRNA-seq данных, а также узнаете о новых подходах к типированию клеток.
Ключевые публикации преподавателей:
https://doi.org/10.3390/ijms21155567
https://doi.org/10.3390/ijms21124442
https://doi.org/10.3390/cells9051272